Rencontres du Végétal

Contexte

La culture de la pomme de terre est exposée à de nombreux bioagresseurs tout au long de son cycle de production, y compris durant la phase de stockage. Les Fusarium spp. sont les principaux agents pathogènes responsables de la fusariose (pourriture sèche) des tubercules. En France, les principaux travaux de recherche concernant la fusariose dataient des années 1980. En effet, pendant des décennies, la maladie a été efficacement maîtrisée par des traitements fongicides appliqués à la récolte sur les plants de pomme de terre. Dans le contexte de restriction progressive des substances actives disponibles et d’évolution du cadre réglementaire, le développement de stratégies alternatives ou complémentaires aux traitements chimiques apparaît indispensable pour assurer la durabilité de la protection sanitaire des plants. Pour répondre à cette problématique, inov3PT a conduit un projet associant les producteurs de plants entre 2022 et 2024.

Objectifs

Les objectifs étaient de :
1) Dresser un état des lieux des espèces de Fusarium actuellement présentes dans les principales régions productrices de plants.
2) Identifier les sources potentielles d’inoculum en conservation.
3) Evaluer des solutions alternatives de lutte en conditions contrôlées.

Démarche et méthodes

Des lots de tubercules présentant des pourritures sèches (148 lots au total) ont été prélevés dans les exploitations des trois régions productrices (Hauts-de-France, Bretagne et Centre-Val-de Loire). Les 165 isolats issus de ces prélèvements ont été caractérisés jusqu’à l’espèce à l’aide de techniques de biologie moléculaire (analyses phylogénétiques des régions ITS et tef1) puis phénotypés (biotests) afin d’évaluer leur niveau d’agressivité ainsi que leur sensibilité aux deux matières actives actuellement homologuées, l’imazalil et le thiabendazole (tests in vitro). Des prélèvements de poussières ont été collectés dans différents environnements des installations de stockage. Leur niveau de contamination par les espèces de Fusarium et d’autres agents pathogènes a été déterminé grâce à des outils de PCR en temps réel, tandis que leur viabilité a été évaluée à l’aide de biotests. Enfin, différents produits (huiles essentielles, extraits de plantes) et une technique physique utilisant la lumière (Technologie Boxilumix®) ont été évalués contre Fusarium sambucinum in vitro.

Résultats obtenus

Les travaux ont permis d’identifier 17 espèces de Fusarium présentes sur le territoire français. L’espèce F. sambucinum reste la plus fréquemment rencontrée (Tivoli, 1988), mais d’autres espèces inféodées à d’autres cultures de la rotation ont également été isolées, notamment F. avenaceum, F. arthrosporioides, F. cerealis et F. culmorum. Le phénotypage révèle que toutes les espèces sont capables d’infecter la pomme de terre avec des intensités plus ou moins importantes. Parmi les différentes espèces testées, seule l’espèce F. sambucinum présente une perte de sensibilité au thiabendazole. Aucune perte de sensibilité à cette substance active n’a été observée chez les autres espèces, et toutes les espèces testées se sont révélées sensibles à l’imazalil.
L’analyse des prélèvements de poussières a révélé la présence de Fusarium spp. viables dans les exploitations, confortant l’hypothèse selon laquelle les poussières constituent un réservoir et un vecteur potentiels de dissémination de ces agents pathogènes.
Enfin, l’évaluation de méthodes alternatives in vitro a permis de mettre en évidence des huiles essentielles intéressantes ainsi qu’un produit associant huiles essentielles et extraits de plantes. La technologie Boxilumix®: lumière modulée de faible puissance [260-800nm] montre des premiers résultats encourageants avec une réduction significative de la viabilité des spores de 4 log par rapport au témoin non traité.

Perspectives

Ce projet a permis d’acquérir de nouvelles connaissances sur l’épidémiologie des Fusarium en stockage. Les prochaines étapes consisteront à poursuivre les campagnes de prélèvements de poussières dans les exploitations afin de pouvoir étudier différentes méthodes de lavage et de désinfection mais également de poursuivre l’évaluation des méthodes alternatives intéressantes directement sur tubercules en traitement post récolte.

Références

Tivoli.B : Guide d'identification des différentes espèces ou variétés de Fusarium rencontrées en France sur la pomme de terre et dans son environnement. Agronomie, 1988, 8 (3), pp.211-222.