Rencontres du Végétal

Le centre de ressources biologiques (CRB) citrus INRAE-Cirad de Corse, certifié ISO9001, regroupe plus de 1100 accessions sous formes d’arbres en verger, en serre Insect Proof et de graines congelées (Cryobanque). La majorité des espèces ancestrales et des formes cultivées y est représentée. La caractérisation de leur diversité génétique est un préambule à la connaissance de l’évolution des agrumes, à la phylogénie des formes cultivées et leur structure génomique. Par ailleurs, l’usage des marqueurs moléculaires permet aussi de subvenir au besoin de traçabilité et d’identification des accessions du CRB. Pour cela nous nous focalisons sur le développement de marqueurs interopérables pour la réalisation d’une banque internationale de CRB citrus. La caractérisation phénotypique s’appuie sue descriptif IPGRI mais en se concentrant sur des caractères quantitatifs agronomiques incluant des descripteurs de la biologie reproductive. Cette caractérisation contribue à adapter les programmes de recherche, les schémas d’amélioration et les modes de culture des variétés de ce conservatoire.
Les agrumes sont reconnus pour leur diversité variétale élevée. Cette diversité résulte de phases évolutives de spéciation allopatrique, de migrations et d’hybridations interspécifiques. Les études de séquençage des génomes ont révélé des évolutions des séquences (codantes ou répétées) propres à chaque espèce et ont aussi consolidé les hypothèses phylogénétiques des variétés cultivées. La diversité des cultivars repose essentiellement sur 5 espèces ancestrales (C. reticulata, C. maxima, C. medica, C. ichangensis et C. micrantha) et les formes cultivées sont des croisements interspécifiques spontanés combinant parfois plusieurs de ces 5 espèces, mais avec un nombre limité d’évènements méiotiques. La plupart de ces formes cultivées possèdent la capacité de multiplication clonale par embryogénie somatique (germination des pépins), qui leur a permis de se maintenir et de se multiplier. Cette apomixie et cette hétérozygotie interspécifique limitent grandement les possibilités d’amélioration de ces hybrides (ex : oranger, pomelo) par croisement et leur diversification ne repose donc que sur la sélection de mutations modifiant peu de caractères (ex de la coloration sanguine chez les oranges). Certains hybrides de pamplemousses (C. maxima) ont hérité de son auto-incompatibilité gamétique inhibant toutes possibilités d’autofécondation. Cette contrainte reproductive associée à la parthénocarpie a été exploitée pour la production de fruits sans pépins dans des vergers de culture monoclonale (ex. clémentinier). Par ailleurs les programmes d’amélioration utilisent ces cultivars auto-incompatibles et monoembryonnés comme parents maternels (récepteurs de pollen) dans les croisements afin de garantir une production simplifiée d’hybrides. Un programme de diversification des mandarines et des limes a été développé à la station INRAE de Corse en s’adaptant aux caractéristiques phylogénétiques et reproductives des variétés du CRB. La gestion de la polyploïdie est partie intégrante de ce programme car permet d’obtenir de la stérilité (fruit sans pépin). Les critères de qualité de production fruitière (rendement, alternance, murissement, sucrosité, acidité, arome…) sont aussi mobilisés dans ces programmes et constituent le socle de la caractérisation phénotypique du CRB citrus.
L’adaptation de la culture des agrumes aux contraintes environnementales, dont le changement climatique, repose essentiellement sur la sélection de porte-greffe. Les critères de tolérance à la salinité, au déficit hydrique, au Phytophtora sp., sont des thématiques de recherche à la station INRAE de Corse, avec un objectif à moyen terme la création de nouveaux porte-greffes plus tolérants à ces contraintes. Les porte-greffes étant multipliés par semis chez les agrumes, les critères d’apomixie (reproduction clonale) et de conservation des pépins font partis de la sélection.